| 2025-03-27 | 漁業取締船 1隻(白鷺代船) | 三菱造船株式会社 | 2,686,000,000円 | |
| 2026-03-17 | 令和8年度放射性物質影響調査推進事業のうち水産物中の放射性物質の影響調査業務 | 公益財団法人海洋生物環境研究所 | 615,454,546円 | |
| 2026-03-19 | 令和8年度スマート水産業情報システム構築推進事業によるスマート水産業情報システム運用・保守業務 | 一般社団法人漁業情報サービスセンター | 440,000,000円 | |
| 2026-03-19 | 令和7年度補正予算スマート水産業情報システム強化緊急事業によるスマート水産業情報システム整備業務 | 一般社団法人漁業情報サービスセンター | 396,000,000円 | |
| 2026-02-27 | 船舶航跡システム(VMAC)に係る船舶用端末等の設置及び保守・運用業務 | 株式会社キュービック・アイ | 346,825,497円 | |
| 2025-10-16 | 漁業取締船「白竜丸」第2種B中間検査及び一般修繕 | 東北ドック鉄工株式会社 | 310,000,000円 | |
| 2025-02-18 | 船舶航跡システム(VMAC)に係る船舶用端末等の設置及び保守・運用業務 | 株式会社キュービック・アイ | 301,242,851円 | |
| 2026-03-17 | 令和8年度有明海のアサリ等の育成技術高度化実証事業 | 一般社団法人マリノフォーラム21 | 295,454,546円 | |
| 2025-03-18 | 令和7年度有明海のアサリ等の育成技術高度化実証事業 | 一般社団法人マリノフォーラム21 | 295,454,546円 | |
| 2024-03-21 | 令和6年度有明海のアサリ等の育成技術高度化実証事業 | 一般社団法人マリノフォーラム21 | 295,454,546円 | |
| 2026-02-16 | 令和7年度補正予算まき網漁業の自動操業に向けたAI技術の開発事業 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 290,796,539円 | |
| 2024-02-27 | 船舶航跡システム(VMAC)に係る管理用端末及び船舶用端末の設置並びに導入・保守・運用業務 | 株式会社キュービック・アイ | 270,872,942円 | |
| 2025-03-18 | 令和7年度養殖業成長産業化技術開発事業 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 251,200,819円 | |
| 2024-03-18 | 令和6年度養殖業成長産業化技術開発事業 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 251,200,819円 | |
| 2026-03-17 | 令和8年度養殖業成長産業化技術開発事業 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 251,181,819円 | |
| 2026-03-17 | 令和8年度新ロードマップに基づく資源管理等高度化促進事業のうち国際資源の管理体制構築促進事業のうち科学オブザーバー調査分析事業 | 公益財団法人海外漁業協力財団 | 215,330,000円 | |
| 2025-03-21 | 令和7年度新ロードマップに基づく資源管理等高度化促進事業のうち国際資源の管理体制構築促進事業のうち科学オブザーバー調査分析事業事業 | 公益財団法人海外漁業協力財団 | 214,980,814円 | |
| 2026-08-21 | 漁業取締船「東光丸」第2A種・第3種中間検査及び一般修繕 | 東北ドック鉄工株式会社 | 195,000,000円 | |
| 2026-04-01 | 漁業取締船「照洋丸」第2種A中間検査及び一般修繕 | 株式会社新来島サノヤス造船 | 180,000,000円 | |
| 2026-01-16 | 令和7年度環境変動に対応した持続的漁業・養殖業構築緊急対策事業のうち漁場環境改善緊急対策事業 | 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 179,454,546円 | |